罗国芝1, 2, 伍煜飞1, 曹宝鑫1, 刘文畅1, 2, 谭洪新1, 2
为探究不同封闭式养殖模式下吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)越冬期间的微生物群落变化,本研究采用高通量测序技术,比较分析了循环水养殖系统(RAS)与生物絮团系统(BFT)中鱼体肠道及水体的微生物群落结构。结果表明,养殖过程中RAS组水体、RAS组生物滤池滤料及BFT组水体的Chao1指数均呈上升趋势,RAS组水体和生物滤池滤料的多样性在末期下降,BFT组水体微生物多样性上升;养殖末期RAS组鱼体肠道与鳃的物种丰富度和多样性均高于BFT组。养殖初期RAS组水体优势菌为变形菌门(Proteobacteria, 75%)和副球菌属(Paracoccus, 34%),BFT组水体的为厚壁菌门(Firmicutes, 86%)和芽孢杆菌属(Bacillus, 85%);养殖末期BFT组水体优势菌门转变为绿弯菌门(Chloroflexi, 43%)。养殖初期鱼体肠道以梭杆菌门(Fusobacteria, 62%)和鲸杆菌属(Cetobacterium, 61%)为主,养殖末期RAS组以变形菌门(35%)和绿弯菌门(31%)为优势菌门,优势菌属为norank_o__JG30-KF-CM45(25%)和包西氏菌属(Bosea, 12%);BFT组优势菌门为变形菌门、放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门,优势属包括芽孢杆菌(16%)、鲸杆菌(13%)和norank_f__Caldilineaceae(13%)。养殖末期BFT组水体与鱼体肠道的微生物群落表现出较强一致性,共同优势菌门包括梭杆菌门、变形菌门、绿弯菌门及拟杆菌门(Bacteroidota);RAS组水体与鱼体肠道间微生物相关性较弱。综上所述,不同养殖模式显著改变了养殖水体和吉富罗非鱼肠道微生物群落结构,利于罗非鱼的健康。与RAS相比,BFT系统更能增加罗非鱼肠道的微生物群落多样性。因此,在越冬养殖过程中,建议将BFT系统作为吉富罗非鱼的优选养殖模式。